㈠ 提取DNA時去除雜質的方法有哪些
雜質：多酚類、糖類物質較多
去除方法：材料粉碎後，在加細胞裂解液前，加入一些緩沖液清洗來除去多糖：緩沖液配比（100mmol/L Tris－HCl，pH8.0；100mmol/L EDTA；250mmol/L NaCl；50ug/mL蛋白酶K；1％月桂酸鈉Nalauroylsarcosine），50度保溫過<Rozman和Komel，1994>，或者只用100mmol/L Tris－HCl溶液清洗<李曉波等，2002>。
去除多酚成分，可以添加Vc等抗氧化劑（參考濃度30～60mmol/L）<胡春根等，1998>和PVP、PEG等酚的結合劑，防止酚類與DNA的結合。
㈡ DNA的純化與分離
DNA純化是指將DNA從細胞中提取出來並消除雜質的過程。
純化DNA的第一步是 破碎細胞 。最簡單的方法是在樣本中加入像十二烷基硫酸鈉（SDS）之類的去垢劑。破碎後通過兩種方法能獲得純凈的DNA。
第一種方法涉及降解和去除DNA之外的所有細胞成分，通過添加化學試劑，配合離心，便可獲取。
第二種方法是選擇性地將DNA從細胞抽提物中移除，主要通過 離子交換層析 （ion-exchange chromatography）技術實現。該方法的基本思想是不同物質（帶負電）吸附在正電荷樹脂上的強度不同，而添加不同濃度的鹽溶液可打破物質與樹脂間的結合，通過層析便能分離DNA、RNA與蛋白質。
分離得細胞總DNA後，往往根據需要打碎DNA大分子，形成長短不一的百餘或數百鹼基的小片段。要想進一步利用這些小片段，如測序、克隆、挑選目的片段等，通常是利用 凝膠電泳 的方法。
凝膠電泳是分離不同長度DNA分子的標准方法。電泳常用的凝膠有兩種： 瓊脂糖（agarose）凝膠和聚丙烯醯胺（polyacrylamide）凝膠 。
如果要對各小片段做克隆，利用質粒載體並需轉化（transformation）回寄主，當要 回收重組子 時，必需去除雜質。此時，影響回收的主要干擾是寄主染色體DNA。為了得到重組子DNA，一種常用的方法利用了這樣一個事實。即雖然質粒和染色體都是由超螺旋DNA構成，但在裂解細菌細胞時不可避免地引起一定量的細菌染色體被打斷，從而引起超螺旋的喪失。因此細胞抽提物就包含了超螺旋的質粒DNA和非超螺旋的染色體DNA，然後通過一種利用不同構象區別DNA分子的方法就可以純化出質粒。一種方法是向細胞抽提物中加入氫氧化鈉直到抽提物的pH達到12.0-12.5，這會引起非超螺旋DNA上的鹼基對斷裂。所產生的單鏈DNA纏繞在一起形成不溶的網狀物，通過離心可以去掉，使超螺旋質粒留在上清中。
有時需要 逐條分離染色體 ，可以利用 流式細胞計數儀 （flow cytometry）實現這一目的。對獲取的全DNA染色，由於結合於染色體的染料量依賴於染色體長度，所以較大的染色體結合的染料更多，其產生的熒光比短的染色體強。稀釋染色體樣品後，將其通過小孔以形成液滴流，其中的每個液滴只含單條染色體。當液滴通過可檢測熒光量的檢測儀時，就可以確定哪一滴含有所需的某一條染色體。將含有所需染色體的液滴帶上電荷，使它們在電場中偏轉並與其他的液滴分開。如果兩個不同不同染色體長度相近時，此時若使用的染料不是非特異性結合DNA的，而是對AT或者GC豐富區有高親和力的染料，如Hoechst33258和染色素A3，就可以將二者分開。這是因為兩條大小相同的染色體很少具有相同的GC含量。
T. A. 布朗. 基因組3[M]. 第一版. 北京: 科學出版社, 2009.
㈢ 蛋白質提取和分離過程中進行透析可除去溶液中的DNA。
透析用的是半透膜，只能去小分子，而DNA是大分子，透不過的。
㈣ 肝臟DNA的提取和質粒DNA提取在原理上的顯著區別
不同點
一、提取方法不同
DNA提取主要是CTAB方法，其他的方法還有物理方式如玻璃珠法、超聲波法、研磨法、凍融法。化學方式如異硫氰酸胍法、鹼裂解法。生物方式：酶法。
質粒抽提方法即去除 RNA，將質粒與細菌基因組 DNA分開，去除蛋白質及其它雜質，以得到相對純凈的質粒。
二、提取原理不同
質粒DNA提取用到三種溶液以及硅酸纖維膜（超濾柱）。 溶液Ⅰ：50 mM葡萄糖 / 25 mMTris-HCl/ 10 mMEDTA，pH 8.0；溶液Ⅱ：0.2 N NaOH / 1%SDS； 溶液Ⅲ：3 M 醋酸鉀/ 2 M 醋酸/75%酒精。
細胞基因組DNA提取
保證核酸一級結構的完整性；核酸樣品中不應存在對酶有抑製作用的有機溶劑和過高濃度的金屬離子；其他生物大分子如蛋白質、多糖和脂類分子的污染應降低到最低程度；其他核酸分子，如RNA，也應盡量去除。
三、提取復雜程度不同
質粒DNA提取一般用沸水浴法和鹼裂解法，它主要是將細胞內的環狀質粒提取出來，一般需要用SDS裂解，RNA酶降解，然後過柱，再進行洗脫.過程比較簡單。
而基因組DNA提取則較為復雜，也需要用SDS裂解和RND酶降解，但降解時間較長，同時對有些革蘭氏陽性細菌還要進行溶菌酶處理，最後用氯仿-苯酚進行除蛋白，這一步重復進行多次，在用氯仿除去多餘的苯酚，用乙醇清洗烘乾後溶於TE緩沖液中。整個過程比提質粒更復雜，耗時也更長。
相同點
都是去除 RNA、除蛋白質及其它雜質。
㈤ 細菌RNA試劑盒提完後有DNA污染，怎麼去除
細菌RNA試劑盒提完後有DNA污染，去除DNA的方法：
做普通pcr，看看條帶對不對。
DNase I 處理，酚氯仿抽，然後isopropanol沉澱，DEPC水溶。
不需專門滅火，因為在反轉錄前有一個步驟是加熱變性。一般是75度5min 後面取不超過40%反轉錄體積的RNA用於反轉錄，但反轉錄前最好檢測一下RNA質量，免得浪費反轉錄酶。
但是，這樣做的前提的，RNA提得要好，濃度要高，這樣免得RNA降解到不能用了。因為在有二價陽離子的（DNAseI buffer含有）情況下，RNA在60度以上時必然發生非酶促降解。
㈥ 提取質粒時這樣去除基因組總DNA
用鹼裂解法提質粒，基因組DNA會與細胞殘骸聚集，而小的質粒DNA溶在水相中，通過離心就能除去；如果還擔心有少量基因組DNA污染，可以電泳後從膠中回收質粒片段；用核酸外切酶也能消化掉線性的DNA，而環形和超螺旋的質粒DNA則得以保留。
㈦ 提取RNA時如何去除DNA的污染
提取RNA時如何去除DNA的污染的方法：
注意實驗室的標准化問題，注意污染的存在，同時嚴格按照說明書上的操作應該沒有
問題。發現DNA污染，用DNAse I 消化1小時，37度
離心取上清的時候，一定要小心不要取到中間的膜和下面的液體。
直接加NaOH溶液與提取液混合攪拌,然後離心就可以了.因為RNA可溶於NaOH溶液,而DNA不可溶,離心後的上清液就不含有DNA了。
RNA提取步驟：
1. 勻漿處理：
①組織 將組織在液氮中磨碎，每50-100mg組織加入1ml TRIzol，用勻漿儀進行勻漿處理。樣品體積不應超過TRIzol體積10%。
②單層培養細胞 直接在培養板中加入TRIzol裂解細胞，每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養板)加1ml，用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應根據培養板面積而定，不取決於細胞數。TRIzol加量不足可能導致提取的RNA有DNA污染。
③細胞懸液 離心收集細胞，每5-10×106動物、植物、酵母細胞或1×107細菌細胞加入1ml TRIzol，反復吸打。加TRIzol之前不要洗滌細胞以免mRNA降解。一些酵母和細菌細胞需用勻漿儀處理。
2. 將勻漿樣品在室溫（15-30℃）放置5分鍾，使核酸蛋白復合物完全分離。
3. 可選步驟：如樣品中含有較多蛋白質，脂肪，多糖或胞外物質（肌肉，植物結節部分等）可於2-8℃10000×g離心10分鍾，取上清。離心得到的沉澱中包括細胞外膜，多糖，高分子量DNA，上清中含有RNA。處理脂肪組織時，上層有大量油脂應去除。取澄清的勻漿液進行下一步操作。
4. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿，劇烈振盪15秒，室溫放置3分鍾。
5. 2-8℃10000×g離心15分鍾。樣品分為三層：底層為黃色有機相，上層為無色水相和一個中間層。RNA主要在水相中，水相體積約為所用TRIzol試劑的60%。
6. 把水相轉移到新管中，如要分離DNA和蛋白質可保留有機相，進一步操作見後。用異丙醇沉澱水相中的RNA。每使用1ml TRIzol加入0.5ml異丙醇，室溫放置10分鍾。
7. 2-8℃10000×g離心10分鍾，離心前看不出RNA沉澱，離心後在管側和管底出現膠狀沉澱。移去上清。
8. 用75%乙醇洗滌RNA沉澱。每使用1ml TRIzol至少加1ml 75%乙醇。2-8℃不超過7500×g離心5分鍾，棄上清。
9. 室溫放置乾燥或真空抽干RNA沉澱，大約晾5-10分鍾即可。不要真空離心乾燥，過於乾燥會導致RNA的溶解性大大降低。加入25-200μl無RNase的水或0.5%SDS，用槍頭吸打幾次，55-60℃放置10分鍾使RNA溶解。如RNA用於酶切反應，勿使用SDS溶液。RNA也可用100%的去離子甲醯胺溶解，-70℃保存。
注意事項：
從少量樣品（1-10mg組織或102-104細胞）中提取RNA時可加入少許糖原以促進RNA沉澱。例如加800ml TRIzol勻漿樣品，沉澱RNA前加5-10μg RNase-free糖原。糖原會與RNA一同沉澱出來，糖原濃度不高於4mg/ml是不影響第一鏈的合成，也不影響PCR反應。
勻漿後加氯仿之前樣品可以在-60至-70℃保存至少一個月。RNA沉澱可以保存於75% 酒精中2-8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。
分層和RNA沉澱時也可使用台式離心機，2600×g離心30-60分鍾。
預期產量：1mg組織或1×106細胞提取RNA分別為：
肝和脾6-10μg，腎3-4μg，骨骼肌和腦組織1-1.5μg，胎盤1-4μg，上皮細胞8-15μg，成纖維細胞5-7μg 。